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自闭症基因突变的评分预测效应

经过/ 2020年7月8日
DNA螺旋与突变或删除
变异评级:分数可以帮助研究人员识别PTEN最有可能在自闭症中发挥作用的基因的变化。

工艺品/科学照片库

一个新的分析将叫做PTEN的基因中的个体突变链接到患有自闭症,癌症或其他条件的人数1。这一发现可能有助于临床医生和研究人员预测该基因各种突变的影响。

PTEN.控制细胞生长并调节神经元之间的连接强度。基因中的突变与各种条件相关,包括自闭症宏观神缺点(头部尺寸扩大),良性肿瘤和几种类型的癌症。目前还不清楚不同的突变如何导致这种变化的效果。

科学家不能根据其类型容易地预测PTEN突变的后果 - 是否涉及单一氨基酸变化或对基因的较大中断,例如 - 或其对基因编码的蛋白质的影响。研究人员已经开发了方法来检查菜肴中细胞内PTEN突变的分子效果,但这些方法不会将突变与人们的特定条件联系起来。

在新分析中,研究人员探讨了7,657个PTEN突变的影响,从而代表基因序列中的每个氨基酸的所有可能变化。他们建立了前一项研究的调查结果二手酵母细胞计算7,244个PTEN突变的“健身分数”2。他们将该数据集与另一个数据集结合在一起,其中研究人员基于这些突变如何影响人体细胞中的蛋白质水平在盘中的蛋白质水平3.

该团队在组合数据集上使用了机器学习,以计算缺乏它们的突变的丰度和健身成绩。然后,他们将这些分数与他们收集的数据从421人聚集在一起 - 165人对照组和256人,具有PTEN相关的病症,如自闭症,发育延迟,智力残疾,野生症或良性或恶性肿瘤。

组合目录:

主持人最大的人往往具有最低健身和丰富分数的突变,6月份报告了美国人遗传学杂志。同样,具有具有严重或出现在年轻时的PTEN相关条件的低分痕迹。

通过将个体中具有PTEN连接的性状的突变和对照组的比较,研究人员还发现,适应性评分可以预测突变是否可能导致PTEN相关的病症。

研究人员说,这些研究结果表明,丰富和健身评分可能有助于预测PTEN突变的后果。

基于对蛋白质功能和丰度的影响,该团队还将单一氨基酸变为三类。

研究人员发现,最严重的突变与癌症诊断的较高可能性与癌症诊断的较高似然相关。更严重的严重程度也随着肿瘤的生长的可能性而追踪。

然而,变体的效果的严重程度与具有自闭症或发育延迟的人的可能性没有贴合。研究人员说,这表明即使PTEN活性的小降低可能足以显着增加具有神经发育状况的含量。

研究人员说,分析可能有助于挑逗PTEN突变的不同效果。它还可以帮助研究人员确定最有可能在自闭症中发挥作用的突变,并优先考虑他们进行进一步研究。


参考:
  1. mighell t.l.等等。是。J. HUM。遗传。106.,818-829(2020)PubMed.
  2. mighell t.l.等等。是。J. HUM。遗传。102.,943-955(2018)PubMed.
  3. matreyek K.A.等等。NAT。遗传50.,874-882(2018)PubMed.