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消息 自闭症研究的最新进展。
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对微生物组在自闭症中的重要性的研究迅速引发了强烈反应

通过/ 2019年6月27日
粪便细菌的显微照片
不是那么快:若干批评者表示,微生物化合物可以易于易于疏松自闭症行为。

Steve Gschmeissner /科学来源

在一项备受瞩目的研究中,许多科学家指出了分析和解释中可能存在的错误,该研究表明微生物可以缓解小鼠的自闭症类行为。Twitter和发表后的评论网站上迅速出现了强烈的反弹PUBPEER.在报纸出版后的几个小时内。

在本文中,30月30日发布细胞,Sarkis Mazmanian他的同事报告说,自闭症男孩的粪便移植可以在老鼠身上引发类似自闭症的行为——以及某些特定的分子微生物可以缓解这些行为

研究发表几分钟后,独立专家开始在Twitter上对论文中包含的三个图表表示担忧。

他们指出,每张图表所附的p值(衡量统计显著性的指标)似乎令人难以置信。

“数据没有通过我称之为眼球测试,”推特之一,凯文米切尔,告诉爱尔兰三一学院都柏林遗传学教授光谱

其他人则对这项研究的样本量太小表示担忧。

“你可以在论文中看到的数据是非常误导的,因为它看起来像是有很多数据点,但他们真的来自少数参与者,”乔恩布罗克他曾是一名自闭症研究人员。布鲁克写了一篇文章,发表于6月13日中等的,批评样本量太小研究人员使用的行为测试。他写道:“鉴于这项研究的声势浩大,支持其核心主张的证据非常薄弱。”

像这样的评论提示托马斯·卢姆利他是一名统计学家,并没有参与这项研究。6月16日,伦莉发布他的再分析在他的个人博客上。他得出结论,其中一项研究的主要结果 - 小鼠社交少于控制 - 可能是由A引起的有缺陷的统计分析

不恰当的分析:

对于有问题的分析,研究人员从每个捐赠者 - 五个男孩的粪便移植到患有自闭症和三个对照中 - 至少八只不同的小鼠。他们发现,作为一个群体,从自闭症男孩埋葬的小鼠比对照组更多的大理石,花费更少的时间与其他小鼠相互作用,并且在开放室中的行进较短的距离。这些结果出现在三格图中,其他结果涉及关于的问题。

但在他们的统计分析中,研究人员似乎独立地对小鼠进行了处理,即使有些人从同一个捐赠者那里获得粪便,Lumley说。这个错误在每个组中人为膨胀样本大小。纠正错误后,唯一的统计学意义差异是小鼠埋藏的大理石的数量,根据他的再分析。

“作者的分析不适合他们的实验设计,也没有明确的描述,因为在论文的两个不同的地方有冲突的描述,”Lumley说,他是新西兰奥克兰大学的生物统计学主席。

研究人员通过他们的原始结果来介绍:“当我们今天坐在这里时,我们发现我们所做的统计数据没有错误,”帕萨迪纳加州理工学院微生物学教授讲述了光谱

Mazmanian说,他已经请了几位统计学家重新分析这些数据。他说:“我们想把这件事做好。”“我们将尽一切可能,确保我们得出一个可以为自己辩护的结论。”

伦利说,虽然Mazmanian的团队已经在网上公布了这些数据,但他们在图表说明中描述的统计方法与论文的“方法”部分的方法不一致,所以他在重新分析中遇到了困难。

“图中的说明很清楚,但并不是他们所做的,”伦莉说。“而且方法那部分写得不清楚。”

统计缺陷:

伦利开始使用标题中描述的方法进行重新分析。这种方法解释了所有粪便移植捐赠者之间的随机差异,然后寻找与自闭症捐赠者相关的差异。

“我认为,这是正确的分析,但它没有给出他们给出的结果;它提供的差异证据少得多,”伦莉说。

然后,根据他在方法部分找到的描述和研究人员在PubPeer上提供的其他细节,他重新分析了数据。他能够重现论文中三个图表中每一个的p值。

不过,他说,研究人员把每只老鼠都当作接受了不同捐赠者的粪便一样对待,这很奇怪。

“这是一个奇怪的分析,”Lumley说。“我看不出任何理由,为什么要刻意做这么做。”

问题可能位于软件中,称为SPSS,研究人员使用,他说:“我不知道这是否有助于他们的问题,但这是容易拥有的那种东西。”(Mazmanian表示,该团队的统计学家遵循该软件的指导方针。)

即使统计分析没有被证明是有缺陷的,批评家们说,这些令人激动的发现需要达到比p值更高的标准。

“p值只是你在实验中得到的数据的总结,”Mitchell说。“如果这是一个不同寻常的说法,如果它需要一些新的未知的生物学机制,而且没有研究基础强有力地支持它,那么我们应该要求更高标准的证据。”

米切尔说,一个更高的标准是复制。另一个是A.登记报告这是一篇经过同行评议的期刊文章,研究人员在收集数据之前首先描述了他们的研究方法。

这篇论文的批评者还指出,研究小组的四名成员已经申请或批准了与使用微生物或微生物分子治疗自闭症和其他疾病有关的专利。Mazmanian也是轴向生物治疗方法这家公司正在开发针对这些疾病的肠道疗法。