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消息 自闭症研究的最新发展。
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扫描继承变体的基因组铺设了裸露的新自闭症候选者

经过/ 10月10日
显示在染色体的五颜六色的图表变形。
新协会:8染色体8(浅绿色)区域中的变体可能会影响一个人的自闭症的几率。

根据一个新的分析,降低了称为DDHD2的基因的表达可能会增加一个人的自闭症的可能性1

研究人员通过基因组 - 范围的结论来到了这种结论,一种用于鉴定常见变体的方法 - 以单字母变化的形式与超过1%的人口中发现的DNA - 与自闭症相关联。

科学家们已经确定了许多人与自闭症相关的罕见变体,但这些账户只为所有病例的一小部分,并且经常自发发生,因此他们无法完全解释为什么自闭症倾向于在家庭中运行。

相比之下,常见的变种,联合主导的研究人员表示,占Autism的遗传性超过50%以上Hyejung赢了,北卡罗来纳大学遗传学教授在Chapel Hill。“这就是为什么我们认为理解这类变异是非常重要的。”

新分析鉴定了涉及自闭症融合的常见变体的基因组的两个新区域。一个区域控制DDHD2的活性,首次将基因与自闭症连接到自闭症。据早期研究,小鼠缺少DDHD2具有电机和认知障碍2

因为基因以前没有与自闭症的关联,结果是基于相对较小的样本,这种发现“应该谨慎地解释,”Tinca Polderman.在阿姆斯特丹UMC的儿童和青少年精神病学助理教授在荷兰,没有参与工作的人。

识别关联:

基于6,222名自闭症人士的数据分析了他们的同事遗传登记处称火花。(Spark是由西蒙斯基金会资助的,光谱’s parent organization.) They also generated an equal number of ‘pseudocontrols’ by using data from the typical parents of autistic children enrolled in SPARK, looking only at the copies of genes, or alleles, the parents did not pass on to their children. This technique differs from other autism GWAS, which use genetic data from unrelated typical controls.

在检查单字母变异或单个核苷酸多态性(SNP)之后,在整个基因组的近900万个位点,研究人员发现两种常见于自闭症的人显着显着,而不是没有这种情况的人。两个变体发生在染色体8的相同区域中,其中DDHD2位于其中。

赢了,她的同事汇集了火花数据2019年GWA.超过18,000人的自闭症和27,000个控制。合并的数据集显示了与自闭症有统计上严格关系的基因组的四个区域,其中三个最初是由2019年工作的。

接下来,该团队试图了解这些变种如何影响个体基因,在这样做,这是一个人患有自闭症的可能性。他们使用他们开发称为H-Magma的生物信息工具来评估来自所有五个自闭症连接区域的变体3.。该工具将SNP链接到基于胎儿组织组织样本中的彼此的3D接近基因。

这种分析标记了263个基因,其中5个具有众所周知的自闭症关系 -KMT2E.rai1.Bcl11a.Foxp1.Foxp2.- 和14显示了从自闭症与控件的人的脑后脑样本中的不同表达模式,包括DDHD2。

They then tested 98 variants near the SNPs on chromosome 8 to gauge their impact on gene expression, using a ‘massively parallel reporter assay’ (MPRA) — a technique that reveals whether a variant can influence the expression of a ‘reporter gene,’ which lights up in cultured cells. One variant in particular strongly dampens gene expression, they found.

从典型的胎儿和成体脑的基因表达数据的额外分析,和从人自闭症死后脑样品,表明该变型衰减DDHD2在大脑中的表达。结果发表于8月份翻译精神病学

小开始:

“我对这项研究的最大关注是相对较小的样本量,”Polderman说。对于这种类型的研究具有足够的统计能力,它应该包括至少25,000名自闭症的数据,并且至少是许多典型的控制。虽然该研究审查了超过24,000人的数据,但DDHD2的调查结果来自大约6000人。

但专家说,该研究有其他优势。

一个实力在额外的分析中 - 特别是MPRA分析 - 旨在解释GWAS信号,说雅各布格罗夫丹麦Aarhus大学的Biomedicine副教授,他没有参与新工作,但领导2019年的研究。

“我期待我们会看到更多的东西,”他说。“GWAS命中本质上很难解释。”

Grove说,使用Gwas的自闭症联系变体的未来狩猎将需要更大的样品。尽管如此,他还在补充说:“看到增加了一个相当大的6k左右,以及识别的衡量标准,这是非常安慰的新基因和新知识。对我来说,这表明该领域是一个良好的轨迹,我们正在稳步前进。“


参考:
  1. Matoba N.等等。翻译。精神病学10.,epub领先于印刷品(2020)PubMed.
  2. inloes准。等等。Proc。Natl。阿卡。SCI。美国111.,14924-14929(2014)PubMed.
  3. sey n.y.a.等等。NAT。neurosci.23.,583-593(2020年)PubMed.
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