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消息 自闭症研究的最新发展。
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DNA的模式标记为自闭症的标记候选基因

经过/ 2019年8月15日
螺旋dna反对黑暗的背景
签名标签:甲基的图案可以区分来自良性突变的有害突变。

Polina Shuvaeva / Istock
编辑注意事项

本文最初于2017年5月13日出版,根据2017年旧金山,加利福尼亚州旧金山的自闭症研究国际会议上提供的初步数据。我们在2019年7月16日出版后,我们更新了文章中的一些数字临床表观遗传学1

在染色体区域进行突变的儿童16P11.2.或者基因CHD8 - 自闭症的主要危险因素 - 在其DNA上显示了不同的化学标签模式。

这些模式将每组儿童区分开与不同的原因有自闭症的其他人。研究人员今天介绍了未发表的结果2017年自闭症研究国际会议在加利福尼亚州旧金山。

研究人员看了一种称为甲基的化学标签。添加该标签通常灭活基因。

“我们已经能够识别敏感和特定的血液DNA甲基化签名,”Michelle Siu.,一个博士后的同伴罗斯娜韦克斯伯格在多伦多病童医院的实验室。

自闭症是臭名昭着的异质的,并且病症的风险与数百个基因中的突变有关。许多这些基因调节其他基因的表达通过所谓的表观遗传机制,例如添加或除去甲基标签至DNA。

研究人员通常通过比较具有典型同龄人的病情的人来研究自闭症中的甲基化模式。思乌说,这种方法产生了不一致的结果。

甲基化阵列

SIU和她的同事试图通过分析分享突变的人的甲基化模式来简化这个问题。他们从九个患儿收集血液中的血液,患有染色体区域16p11.2的染色体区域,七个患者在CHD8的一份副本中携带六个。他们还研究了30个典型的控制以及52个控制,患有自闭症,但在16P11.2或CHD8中没有突变。

该分析显示了基因组中的任何位点,其中两个对照组之间的甲基化在显着不同。这表明整个自闭症组没有签名。

当研究人员将分析限制对16P11.2缺失和23次和性别匹配的对照组时,它们在基因组中鉴定了115个位点,差异甲基化。其中一些位点是涉及免疫系统的基因。

同样,当研究人员专注于患有CHD8突变和21种匹配的对照时,他们发现103个不同。这些位点与调节神经元形成的基因和它们之间的连接 - 已知的过程中,以自闭症的人改变。

然而,两个突变特异性组中的模式显示没有重叠。

区分模式

然后,研究人员在16P11.2中分析了九种其他儿童的甲基化模式。这些儿童中的七种具有比对控制模式更类似于16p11.2的甲基化模式。在与签名不匹配的两个孩子中,只有在他的细胞的子集中携带突变,另一个涉及染色体中的小于常见的缺失。

研究人员还分析了四种额外的儿童的甲基化模式,在CHD8和9中具有有害突变,良性突变或基因中未知意义的变异。有害突变的儿童具有匹配CHD8签名的甲基化模式;剩下的孩子们没有。

Siu说:“这种特征能够区分致病和良性变异。”

研究人员正在分析16P11.2中具有重复的儿童的甲基化模式,这也是自闭症的危险因素。

有关更多报告201.7.国际自闭症研究会议,请点击这里


参考:
  1. SIU M.T.等等。临床。表观遗传学11.,103(2019)PubMed.